Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad18Q9QXK2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad18Q9QXK2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms