Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Apbb1Q9QXJ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apbb1Q9QXJ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apbb1Q9QXJ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms