Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rai2Q9QVY8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rai2Q9QVY8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms