Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr4Q9QUK6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlr4Q9QUK6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms