Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdkl2Q9QUK0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdkl2Q9QUK0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms