Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain4Q9JMG4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain4Q9JMG4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain4Q9JMG4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkain4Q9JMG4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkain4Q9JMG4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkain4Q9JMG4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms