Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfmbt1Q9JMD1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfmbt1Q9JMD1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms