Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rabgef1Q9JM13 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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