Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gde1Q9JL56 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gde1Q9JL56 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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