Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot9Q9JKY0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnot9Q9JKY0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms