Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk3aQ9JKX8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk3aQ9JKX8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms