Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nectin1Q9JKF6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nectin1Q9JKF6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nectin1Q9JKF6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms