Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trem1Q9JKE2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trem1Q9JKE2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms