Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ybx3Q9JKB3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ybx3Q9JKB3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ybx3Q9JKB3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms