Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcnq4Q9JK97 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnq4Q9JK97 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnq4Q9JK97 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms