Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc86Q9JJ89 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc86Q9JJ89 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc86Q9JJ89 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms