Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ercc6l2Q9JIM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms