Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp1r3fQ9JIG4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r3fQ9JIG4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r3fQ9JIG4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms