Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb1Q9JIF7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb1Q9JIF7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms