Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcirg1Q9JHF5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms