Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13bQ9ET35 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms