Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Brd4Q9ESU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Brd4Q9ESU6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Brd4Q9ESU6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brd4Q9ESU6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms