Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp29Q9ES63 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp29Q9ES63 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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