Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc4Q9ES56 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc4Q9ES56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms