Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk4Q9ERK0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk4Q9ERK0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms