Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upf1Q9EPU0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upf1Q9EPU0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms