Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC58

Dram1, DNA damage-regulated autophagy modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dram1Q9DC58 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dram1Q9DC58 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dram1Q9DC58 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dram1Q9DC58 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms