Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf6Q9DBU5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf6Q9DBU5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf6Q9DBU5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms