Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prkar1aQ9DBC7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prkar1aQ9DBC7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms