Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Smg9Q9DB90 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smg9Q9DB90 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms