Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9S1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9D9S1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9S1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9D9S1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms