Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot8Q9D8X5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot8Q9D8X5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnot8Q9D8X5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnot8Q9D8X5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1834 ms