Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifrd2Q9D8U0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ifrd2Q9D8U0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms