Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23bQ9D8T4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tvp23bQ9D8T4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms