Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8L0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8L0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8L0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8L0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8L0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8L0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8L0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8L0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8L0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8L0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8L0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8L0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8L0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8L0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8L0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8L0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8L0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8L0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8L0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8L0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8L0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8L0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8L0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8L0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8L0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8L0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8L0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D8L0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms