Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fip1l1Q9D824 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fip1l1Q9D824 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms