Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rep15Q9D7T1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms