Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capns2Q9D7J7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capns2Q9D7J7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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