Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MsraQ9D6Y7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MsraQ9D6Y7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms