Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Calml3Q9D6P8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Calml3Q9D6P8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calml3Q9D6P8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms