Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc94Q9D6J3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms