Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab11fip1Q9D620 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab11fip1Q9D620 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab11fip1Q9D620 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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