Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4f1Q9D5Q6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Speer4f1Q9D5Q6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms