Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrameQ9D4Z5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrameQ9D4Z5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms