Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D4W2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D4W2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D4W2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D4W2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D4W2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms