Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms