Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc6Q9D4E6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms