Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Syce1Q9D495 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syce1Q9D495 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syce1Q9D495 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms