Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sohlh2Q9D489 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sohlh2Q9D489 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms