Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap53Q9D439 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap53Q9D439 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap53Q9D439 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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